临床研究丨全外显子测序辅助产前诊断转醛醇酶缺乏症

导读

转醛醇酶(TALDO)缺乏是一种罕见的常染色体隐性遗传疾病，由TALDO1基因变异，是一种罕见的先天性戊糖磷酸通路（pentosephosphatepathway，PPP）缺陷累计的多系统遗传疾病，表现为严重、早期发病的多系统疾病。报道病例只有几十例，TALDO缺乏症的病理生理学仍不清楚。TALDO缺乏症的临床表现和结果也可能具有高度可变性，即使在同一个家庭中不同患者表现不同。本病目前为止没有有效的治疗方法，主要对症支持治疗，早期肝移植可能有效，但仍存在疾病复发的风险。

案例介绍

通过伦理委员会批准进行家系全外显子测序。一名33岁孕妇，34周时因超声异常入院。胎儿大脑中动脉收缩期峰值速度（MCA-PSV）从孕24周开始持续增加，在孕33周达到93.97cm/s[>1.5MoM（中位数的倍数）]。其他异常包括肝右叶略高回声、心脏扩大（心胸比为0.61）、少量心包积液和胎盘厚度46mm。

由于有过类似孕史，本次为了评估复发风险，在另一家医院进行了两次脐带穿刺进行基因诊断，包括核型分析和染色体微阵列分析（CMA），以明确该疾病的潜在原因，但结果均为阴性。因此，对先证者及其健康的父母进行了WES（图 1A、B) 来寻找潜在的致病变异。孕期的详细检查见表1。

表1 不同孕周的超声检查结果

图1 （A）家系图。(B) TALDO1基因的测序。揭示了两个杂合变异，导致核苷酸位置 462-2（c.462-2A > G）的 A 到 G 剪接和核苷酸位置的 C 到 T 替换574 [c.574C > T(p.Arg192Cyrs)]。Het，杂合子。

全外测序分析和验证

使用 IIIumina HiSeq 2500 测序仪进行全外测序 ，每个样本的最小数据量为 10.14 Gb。质量控制后的测序数据通过 BWA (hg19) 与人类参考基因组进行比对。针对1000 Genomes数据库(http://www.1000genomes.org/)、dbSNP数据库 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_summary.cgi)和基因组聚合数据库 ( gnomad.broadinstitute.org）。使用包括ClinVar、OMIM、ClinGen和人类基因突变数据库及软件（SIFT、Polyphen、MutationTaster、PROVEAN和REVEL）用于预测错义变异的影响。对于剪接突变，使用的计算机预测工具是dbscSNV和MaxEntScan。消除常见变异（在正常人群中具有高次要等位基因频率；gnomAD）。最后，使用特异性引物进行聚合酶链式反应 (PCR) 以扩增TALDO1基因的受影响片段，并将纯化的PCR产物应用于Sanger测序以确认变异。

结果

这对夫妇在遗传咨询后决定继续怀孕。一名女婴在38周时出生，体重为2,760 克。分娩后Apgar评分正常（8'-8'-8'）。出生时，婴儿有畸形特征（多毛、低植发）、轻度苍白和皮肤松弛。她还表现出皮肤温度低，呼吸急促伴呻吟，双肺呼吸音粗伴湿啰音，腹胀可见血管网。宝宝在院新生儿科住院9天，有肝脾肿大并出现黄疸。外周血检查显示 HGB 为 95 g/L（正常 110-150 g/L），膜上有碎裂的红细胞、血小板减少和轻度中性粒细胞减少，与子宫内的一致。血清TBIL为 83.3 µmol/L（正常 2–17 µmol/L），DBIL 为 10.0 µmol/L（正常 0–7 µmol/L）。LDH 也增加到 989 U/L（正常 159-322 U/L），同时转氨酶、胆汁酸和碱性磷酸酶（ALP）略有升高。白蛋白为 23.1 g/L（正常 40-55 g/L），PT 为 31.7 s（正常 11-15 s）。婴儿接受连续通气9天。给予新鲜冷冻血浆和纤维蛋白原输注以改善血小板减少和凝血。血糖水平稳定并受到密切监测。GC-MS 表明尿木糖醇 + 阿糖醇和核糖醇水平升高。

病情逐渐好转后，患者出院并定期随访。9个月大时，HGB仍略有下降（100 g/L），而红细胞和PLT均升高至4.7×10 12/L（正常3.5-5.0×10 12/L）和517×10 9/L（正常 100–300 × 10 9/L）。DBIL、TBIL、TBA、LDH 和 AKP 水平正常，而天冬氨酸氨基转移酶 (AST) 轻度升高至 84 U/L。未观察到畸形特征和皮肤松弛。到目前为止，该名个体已经表现出正常的身体和认知发育。

研究意义

本文使用全外显子组测序(WES)和Sanger测序，报道了一个中国产前TALDO缺陷病例的复合杂合变异。变异位于TALDO1基因上，NM_006755.2 :c.574C>T(Chr11:g.763456C>T)，遗传父亲的错义突变；NM_006755.2:c.462-2A>G(Chr11:g.763342A>G)，遗传母亲的剪切位点突变。新生儿尿液中尿多元醇的定性分析表明，先证者尿液中的木糖醇+阿糖醇和核糖醇显着增加。这些发现扩大了TALDO1基因的变异谱，为家庭对未来妊娠的咨询提供了坚实的证据，有力地支持了WES在产前诊断中的应用，进一步证明了有效的产后治疗可以改善预后。

近期活动

推荐阅读

END

本文为伯豪生物原创

撰稿人：李宁

欢迎转发朋友圈

转载请注明来自伯豪生物

咨询热线：17702139967   

邮箱：[e-mail]  

发现“分享”和“赞”了吗，戳我看看吧